畜牧人

標(biāo)題: 請(qǐng)教"遺傳貢獻(xiàn)量"的計(jì)算方法 [打印本頁(yè)]

作者: shfujim    時(shí)間: 2009-12-10 21:46
標(biāo)題: 請(qǐng)教"遺傳貢獻(xiàn)量"的計(jì)算方法
遺傳貢獻(xiàn)率(genetic contribution)是怎么個(gè)概念?具體是怎么計(jì)算的呢?先謝謝大家了
作者: cqhcsf    時(shí)間: 2009-12-15 19:27
呵呵,沒(méi)有聽(tīng)說(shuō)過(guò),不過(guò)看字面意思應(yīng)該是和遺傳力差不多吧,計(jì)算方法也應(yīng)該是遺傳力的方法
作者: ew2002    時(shí)間: 2009-12-17 02:35
我想應(yīng)該是某一個(gè)體到其某個(gè)后代個(gè)體的通徑系數(shù)吧
作者: cqs4000    時(shí)間: 2010-1-6 23:46
育種值與表型值之比
作者: zhuwenwen    時(shí)間: 2010-1-8 09:09
遺傳貢獻(xiàn)率的計(jì)算

  假如后代群體(由具繁殖能力的育成個(gè)體組成)含量為N,原始祖先到達(dá)后代群體的最高代數(shù)為n,那么某一原始祖先對(duì)后代群體的遺傳貢獻(xiàn)率為:
其中,y為某一原始祖先對(duì)后代群體的遺傳貢獻(xiàn)率;N為后代群體含量;n為原始祖先到達(dá)后代的通徑所經(jīng)過(guò)的代數(shù);xi為原始祖先到達(dá)后代的通徑線(xiàn)數(shù)。
 所有原始祖先對(duì)后代群體的遺傳貢獻(xiàn)總和為1,即Σy=1。當(dāng)N=1時(shí),為某一原始祖先對(duì)某一后代的遺傳貢獻(xiàn)率。
當(dāng)所有通徑線(xiàn)長(zhǎng)度相等(如無(wú)世代交叉的群體繼代選育)時(shí),公式(1)可以簡(jiǎn)化為:
y=1/N×0.5ixi=xi/(N×2i) (2)
其中,2i為后代群體中某一個(gè)體到達(dá)原始祖先的所有通徑線(xiàn)數(shù);N×2i為后代群體到達(dá)原始祖先群體的所有通徑線(xiàn)數(shù),即原始祖先群體到達(dá)后代群體的所有通徑線(xiàn)數(shù)。
從公式(2)可以得出,某一原始祖先對(duì)后代群體的遺傳貢獻(xiàn)率為這一祖先到達(dá)后代群體的通徑線(xiàn)數(shù)占所有原始祖先到達(dá)后代群體的總通徑線(xiàn)數(shù)的比例。
作者: manfu2000    時(shí)間: 2010-1-9 09:17
:shuya::shuya:
作者: 牧童    時(shí)間: 2010-1-13 10:19
 在豬品種(系)形成過(guò)程中,祖先對(duì)后代群體的遺傳貢獻(xiàn)各不相同。在如何選種及祖先對(duì)后代的遺傳貢獻(xiàn)方面,許多學(xué)者從不同角度進(jìn)行了研究[1~3]。楊寧等定義每個(gè)親本所產(chǎn)生的育成后代數(shù)占后代總數(shù)的百分比為該親本對(duì)后代群體的遺傳貢獻(xiàn)率,并用這一指標(biāo)衡量該父母本對(duì)后代基因庫(kù)的相對(duì)重要性[3]。
作者: 牧童    時(shí)間: 2010-1-13 10:28
北京花豬Ⅱ系形成的貢獻(xiàn)率分析

張創(chuàng)貴

     北京花豬Ⅱ系是采用合成系制種方法形成的新品系,為了研究參與北京花豬Ⅱ系形成的各個(gè)品種所起的遺傳影響的大小,特收集北京花豬Ⅱ系形成和選育過(guò)程中的種豬譜系,探討北京花豬Ⅰ系、長(zhǎng)白豬和施格豬對(duì)北京花豬Ⅱ系形成所產(chǎn)生的遺傳影響程度。采用貢獻(xiàn)率這一技術(shù)指標(biāo)表示原始基礎(chǔ)制種豬(北京花豬Ⅰ系等)對(duì)北京花豬Ⅱ系的遺傳影響程度。以下對(duì)這方面研究原理、方法、材料和結(jié)果進(jìn)行討論。

一、貢獻(xiàn)率的計(jì)算原理

    從以下兩個(gè)角度計(jì)算的貢獻(xiàn)率可視為祖先個(gè)體在后代群體或個(gè)體中的基因頻率。

    1.某個(gè)雄性或雌性祖先對(duì)后代的貢獻(xiàn)率

     RXp→Xo=∑(1/2)n              …………… (1)

     n—祖先個(gè)體到后代個(gè)體的世代數(shù);

     ∑—各通徑鏈求和.

    所有與該個(gè)體相關(guān)的祖先貢獻(xiàn)率之和等于1;所有雌雄兩性祖先到個(gè)體的通徑鏈代數(shù)相同時(shí),兩性貢獻(xiàn)率均分別為0.5。

    2.某個(gè)雄性或雌性祖先對(duì)后代群體的貢獻(xiàn)率是該祖先對(duì)所有有關(guān)個(gè)體貢獻(xiàn)率的加權(quán)平均值。

     RXp→Gi=∑∑w(1/2)n/2ND         …………… (2)

w—加權(quán)系數(shù),如世代個(gè)體為♂,則w=ND/NS,如世代個(gè)體為♀,則w=1;

ND—群體中母豬個(gè)數(shù);

     NS—群體中公豬個(gè)數(shù);

     'n'與'∑'的含義與(1)式相同.

    所有基礎(chǔ)制種祖先雌雄兩性豬對(duì)后代群體的貢獻(xiàn)率之和=1,所有雌雄兩性祖先到個(gè)體的通徑鏈代數(shù)相同時(shí),雌雄兩性祖先各自貢獻(xiàn)率均分別為0.5。

二、貢獻(xiàn)率的計(jì)算方法

    在計(jì)算貢獻(xiàn)率時(shí),為了方便計(jì)算機(jī)成批計(jì)算,我們可以根據(jù)譜系按頻數(shù)進(jìn)行。舉例:

    60號(hào)母豬個(gè)體譜系如下,按(1)式計(jì)算:

     R34→60=(1/2)3+(1/2) 3=0.25

     R56→60=(1/2) 3         =0.125

     R361→60=(1/2)2        =0.25

     R526→60=(1/2) 3        =0.125

     R226→60=(1/2) 3        =0.125

     R422→60=(1/2) 3        =0.125

    如果不按(1)式計(jì)算,可以按頻數(shù)計(jì)算,先數(shù)某個(gè)體最早出現(xiàn)的所有祖先應(yīng)有個(gè)數(shù)N,補(bǔ)充祖先個(gè)體按出現(xiàn)在通徑鏈的位置加倍,晚n代,加2n倍;然后計(jì)算各祖先個(gè)體出現(xiàn)的頻數(shù)ni,除以N,即該祖先對(duì)后代個(gè)體的貢獻(xiàn)率。

仍舉上例:N=8



祖先耳號(hào)
34
56
361
562
226
421
合計(jì)

頻數(shù)
2
1
2
1
1
1
8

貢獻(xiàn)率
0.25
.125
0.25
.125
.125
.125
1


   注:這里361是補(bǔ)充祖先個(gè)體,507、115不是最早祖先,因361晚出現(xiàn) 1代,故頻數(shù)為21=2.

    祖先個(gè)體對(duì)后代群體的貢獻(xiàn)率則可按下式計(jì)算:

     RXp→Gi=(∑ni/2NS+∑nj/2ND)/N  …(3)

      ∑ni、∑nj—祖先個(gè)體對(duì)后代公豬、后代母豬的頻數(shù)和.

    我們即用這一方法計(jì)算得出北京花豬Ⅱ系祖先豬對(duì)各世代豬群的貢獻(xiàn)率的結(jié)果。

三、材料

    我們收集整理北京花豬Ⅱ系各代譜系共476頭(份),其中原始制種豬28份(♂12♀16)、雜交代33份(♂10♀23)、合成代34份(♂ 4♀30)、零世代63份(♂18♀45)、一世代76份(♂18♀58)、二世代68份(♂21♀47)、三世代76份(♂19♀57)、四世代98份(♂21♀77)。

四、結(jié)果及分析

    1.表1 列出制種祖先雌雄兩性豬對(duì)各世代豬群的各自貢獻(xiàn)率,雌雄兩性對(duì)各世代群的貢獻(xiàn)率合計(jì)均為1.0000±0.0001,符合貢獻(xiàn)率的原理。祖先公豬及祖先母豬貢獻(xiàn)率除雜交代分別為0.5以外,均不等于0.5,也符合提出的規(guī)律。

    主要的原因是在部分開(kāi)放的系統(tǒng)選育中,新補(bǔ)充的雌性或雄性祖先,尤其雄性祖先占用了其他制種祖先的貢獻(xiàn)率份額。如前例中的361公豬即占用了上代雌性的貢獻(xiàn)率0.125。

    2.表2 列出制種祖先豬品種分類(lèi)貢獻(xiàn)率。可以看出長(zhǎng)白豬在各世代群的貢獻(xiàn)率逐漸升高,然后降低,四世代為37.33%;施格豬則升降有變,穩(wěn)定在8%到9.5%之間;北京花豬Ⅰ系在后代群的貢獻(xiàn)率在53—55%。

    3.祖先個(gè)體對(duì)后代的貢獻(xiàn)率有多有少,由表1 可知祖先公豬貢獻(xiàn)率大于10%以上的有34、56;在3—5%的有322、532、76、361、511。

    祖先母豬貢獻(xiàn)率大于5%的有562、226、384;在2—4%的有33、93、421、95、499、526。也就是說(shuō)后代群體集中了在這些優(yōu)秀個(gè)體的基因,從而保證了選育的高質(zhì)量完成。
 
作者: shfujim    時(shí)間: 2010-1-30 11:28
:)3:謝謝諸位阿,我再好好理解理解。




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