畜牧人

標題: 請教"遺傳貢獻量"的計算方法 [打印本頁]
作者: shfujim    時間: 2009-12-10 21:46
標題: 請教"遺傳貢獻量"的計算方法
遺傳貢獻率（genetic contribution）是怎么個概念？具體是怎么計算的呢？先謝謝大家了
作者: cqhcsf    時間: 2009-12-15 19:27
呵呵，沒有聽說過，不過看字面意思應該是和遺傳力差不多吧，計算方法也應該是遺傳力的方法
作者: ew2002    時間: 2009-12-17 02:35
我想應該是某一個體到其某個后代個體的通徑系數(shù)吧
作者: cqs4000    時間: 2010-1-6 23:46
育種值與表型值之比
作者: zhuwenwen    時間: 2010-1-8 09:09
遺傳貢獻率的計算

　　假如后代群體(由具繁殖能力的育成個體組成)含量為N,原始祖先到達后代群體的最高代數(shù)為n,那么某一原始祖先對后代群體的遺傳貢獻率為:
其中,y為某一原始祖先對后代群體的遺傳貢獻率;N為后代群體含量;n為原始祖先到達后代的通徑所經(jīng)過的代數(shù);xi為原始祖先到達后代的通徑線數(shù)。
　所有原始祖先對后代群體的遺傳貢獻總和為1,即Σy=1。當N=1時,為某一原始祖先對某一后代的遺傳貢獻率。
當所有通徑線長度相等(如無世代交叉的群體繼代選育)時,公式(1)可以簡化為:
y=1/N×0.5ixi=xi/(N×2i) (2)
其中,2i為后代群體中某一個體到達原始祖先的所有通徑線數(shù);N×2i為后代群體到達原始祖先群體的所有通徑線數(shù),即原始祖先群體到達后代群體的所有通徑線數(shù)。
從公式(2)可以得出,某一原始祖先對后代群體的遺傳貢獻率為這一祖先到達后代群體的通徑線數(shù)占所有原始祖先到達后代群體的總通徑線數(shù)的比例。
作者: manfu2000    時間: 2010-1-9 09:17
:shuya::shuya:
作者: 牧童    時間: 2010-1-13 10:19
　在豬品種(系)形成過程中,祖先對后代群體的遺傳貢獻各不相同。在如何選種及祖先對后代的遺傳貢獻方面,許多學者從不同角度進行了研究[1~3]。楊寧等定義每個親本所產(chǎn)生的育成后代數(shù)占后代總數(shù)的百分比為該親本對后代群體的遺傳貢獻率,并用這一指標衡量該父母本對后代基因庫的相對重要性[3]。
作者: 牧童    時間: 2010-1-13 10:28
北京花豬Ⅱ系形成的貢獻率分析

張創(chuàng)貴

     北京花豬Ⅱ系是采用合成系制種方法形成的新品系，為了研究參與北京花豬Ⅱ系形成的各個品種所起的遺傳影響的大小，特收集北京花豬Ⅱ系形成和選育過程中的種豬譜系，探討北京花豬Ⅰ系、長白豬和施格豬對北京花豬Ⅱ系形成所產(chǎn)生的遺傳影響程度。采用貢獻率這一技術指標表示原始基礎制種豬（北京花豬Ⅰ系等）對北京花豬Ⅱ系的遺傳影響程度。以下對這方面研究原理、方法、材料和結果進行討論。

一、貢獻率的計算原理

    從以下兩個角度計算的貢獻率可視為祖先個體在后代群體或個體中的基因頻率。

    1.某個雄性或雌性祖先對后代的貢獻率

     RXp→Xo=∑（1／2）n              …………… （1）

     n—祖先個體到后代個體的世代數(shù);

     ∑—各通徑鏈求和.

    所有與該個體相關的祖先貢獻率之和等于1;所有雌雄兩性祖先到個體的通徑鏈代數(shù)相同時，兩性貢獻率均分別為0.5。

    2.某個雄性或雌性祖先對后代群體的貢獻率是該祖先對所有有關個體貢獻率的加權平均值。

     RXp→Gi=∑∑w(1/2)n／2ND         …………… （2）

w—加權系數(shù),如世代個體為♂,則w=ND／NS,如世代個體為♀,則w=1;

ND—群體中母豬個數(shù);

     NS—群體中公豬個數(shù);

     'n'與'∑'的含義與（1）式相同.

    所有基礎制種祖先雌雄兩性豬對后代群體的貢獻率之和=1，所有雌雄兩性祖先到個體的通徑鏈代數(shù)相同時，雌雄兩性祖先各自貢獻率均分別為0.5。

二、貢獻率的計算方法

    在計算貢獻率時，為了方便計算機成批計算，我們可以根據(jù)譜系按頻數(shù)進行。舉例：

    60號母豬個體譜系如下，按（1）式計算：

     R34→60=(1/2)3+(1/2) 3=0.25

     R56→60=(1/2) 3         =0.125

     R361→60=(1/2)2        =0.25

     R526→60=(1/2) 3        =0.125

     R226→60=(1/2) 3        =0.125

     R422→60=(1/2) 3        =0.125

    如果不按（1）式計算,可以按頻數(shù)計算，先數(shù)某個體最早出現(xiàn)的所有祖先應有個數(shù)N，補充祖先個體按出現(xiàn)在通徑鏈的位置加倍，晚n代，加2n倍；然后計算各祖先個體出現(xiàn)的頻數(shù)ni，除以N，即該祖先對后代個體的貢獻率。

仍舉上例：N=8



祖先耳號
34
56
361
562
226
421
合計

頻數(shù)
2
1
2
1
1
1
8

貢獻率
0.25
.125
0.25
.125
.125
.125
1


   注：這里361是補充祖先個體，507、115不是最早祖先，因361晚出現(xiàn) 1代,故頻數(shù)為21=2.

    祖先個體對后代群體的貢獻率則可按下式計算：

     RXp→Gi=（∑ni/2NS+∑nj/2ND）／N  …（3）

      ∑ni、∑nj—祖先個體對后代公豬、后代母豬的頻數(shù)和.

    我們即用這一方法計算得出北京花豬Ⅱ系祖先豬對各世代豬群的貢獻率的結果。

三、材料

    我們收集整理北京花豬Ⅱ系各代譜系共476頭（份）,其中原始制種豬28份（♂12♀16）、雜交代33份（♂10♀23）、合成代34份（♂ 4♀30）、零世代63份（♂18♀45）、一世代76份（♂18♀58）、二世代68份（♂21♀47）、三世代76份（♂19♀57）、四世代98份（♂21♀77）。

四、結果及分析

    1.表1 列出制種祖先雌雄兩性豬對各世代豬群的各自貢獻率，雌雄兩性對各世代群的貢獻率合計均為1.0000±0.0001，符合貢獻率的原理。祖先公豬及祖先母豬貢獻率除雜交代分別為0.5以外，均不等于0.5，也符合提出的規(guī)律。

    主要的原因是在部分開放的系統(tǒng)選育中，新補充的雌性或雄性祖先，尤其雄性祖先占用了其他制種祖先的貢獻率份額。如前例中的361公豬即占用了上代雌性的貢獻率0.125。

    2.表2 列出制種祖先豬品種分類貢獻率。可以看出長白豬在各世代群的貢獻率逐漸升高，然后降低，四世代為37.33％；施格豬則升降有變，穩(wěn)定在8％到9.5％之間；北京花豬Ⅰ系在后代群的貢獻率在53—55％。

    3.祖先個體對后代的貢獻率有多有少，由表1 可知祖先公豬貢獻率大于10％以上的有34、56；在3—5％的有322、532、76、361、511。

    祖先母豬貢獻率大于5％的有562、226、384；在2—4％的有33、93、421、95、499、526。也就是說后代群體集中了在這些優(yōu)秀個體的基因，從而保證了選育的高質量完成。
　
作者: shfujim    時間: 2010-1-30 11:28
:)3:謝謝諸位阿，我再好好理解理解。



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